番茄為全球第二大栽培蔬菜作物，但卻面對嚴重的土壤傳播性病害，其中又以「青枯病」對產量衝擊最大，目前商用番茄品種缺乏強抗病能力，農民多透過「嫁接抗病茄子根砧」來維持番茄生產；然而隨著農民普遍使用自留種，部分茄子根砧的抗病性已有退化跡象。為協助產業提升嫁接苗品質與抗病力，農業部種苗改良繁殖場針對常用茄子根砧材料進行系統性抗病檢測與種源強化，成果可望進一步提升國內番茄生產穩定性。

　　種苗場選用育苗場與種子公司常用之茄子根砧材料，進行青枯病人工接種試驗，結果顯示市售雜交一代品種如「鳳山3號」、「台南1號」等表現穩定，罹病率低於20%；亞蔬中心選育之自交系EG195也展現出優異抗性，顯著優於其他自留種來源。

　　為確保根砧抗病性穩定傳遞，種苗場從上述抗病表現優異的單株中，進行種傳病害（如類病毒）檢測，篩選出無特定病原（SPF, Specific Pathogen Free）茄砧，並收集第二代種子。試驗結果證實，第二代種子的抗病表現明顯優於第一代，顯示透過選拔與種子潔淨化處理可成功建立具穩定抗性的核心種原，為育苗業者提供可靠的種子來源。

　　種苗場為強化選育效率，團隊除了建立核心抗病茄砧種原外，並嘗試開發分子標誌開發。經分析40組文獻SSR標誌後，篩選出最具多型性的SSR標誌emb01J19，成功針對該區段探勘出2個具潛力之SNP位點，目前正進一步設計適用於育種與種子檢測之選拔工具。

　　種苗場表示，透過茄子根砧抗病性驗證、自交種源純化與分子輔助選拔三管齊下策略，番茄青枯病的防治可望從源頭落實。該場相信藉由向農民與育苗業者推展優先選用抗病穩定的嫁接茄砧，必能減少病害損失、提升產量與收益，邁向高品質、安全穩定的蔬果生產體系。